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时间: 2020年02月20日 09:35 | 来源: 【→々帝都〆←】 | 编辑: 左丘瀚逸 | 阅读: 4674 次

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尽管癌细胞基因组中的蛋白质编码基因通常存在骤变景象,但关于非编码区域来说,它们的骤变也会致使肿瘤的成长。近来一项研讨则从乳腺癌中找到了这么的比如。

尽管癌细胞基因组中的蛋白质编码基因通常存在骤变景象,但关于非编码区域来说,它们的骤变也会致使肿瘤的成长。近来一项研讨则从乳腺癌中找到了这么的比如。

癌症基因组有关的研讨现已有20年的前史,基因组中2%的蛋白质编码序列关于研讨者们来说现已是丰厚的保藏,其间研讨者们现已找到了数百种与癌症发作有关的基因骤变,然后推进了多种癌症靶向疗法的开发。

而剩下的98%的基因组序列则都没有蛋白质编码功用,它们担任发作一些调控元件,介导基因表达的敞开与封闭。但是这有些序列的骤变关于癌症的影响现在研讨并不明白,而这并不是因为研讨者们缺少爱好致使的。

近来宣布在《Nature》杂志上的一篇文章中,研讨者们发现乳腺癌基因组的最少9个基因的启动子区域存在显着的基因骤变。这一发现除了提醒更多的与乳腺癌发作有关的新式基因以外,还协助群众了解到一类已知的基因是怎么协助乳腺肿瘤细胞逃脱医治的。

事实上,最早有关启动子区域骤变的研讨开始于2013年,其时有两项研讨发现黑色素瘤细胞中的TERT基因的启动子区域存在骤变景象。这一发现是初次对癌症基因组的"暗物质"进行探究。

那么,为何后续没有更多的研讨呈现呢?首要原因是启动子的DNA序列富含CG碱基对,这一特征不利于测序技能的使用,因而难以精确地检查基因组的序列特征。

对此,Rheinbay与Getz团队采取了别的一种战略:他们开发出了一种技能,可以捕捉启动子区域的序列,然后进行定向的测序。(关于某一种基因,有一个独自的启动子进行调控,互相是一对一的联系)。这一技能可以完成对高CG含量的DNA序列进行精确测定。

成果显现,乳腺癌细胞中的9类基因的启动子区域存在大幅骤变景象:FOXA1, TBC1D12, RMRP/CCDC107, NEAT1, LEPROTL1, ALDOA, ZNF143, CITED2, 以及 CTNNB1.这些骤变非常稀有,但关于癌症的发作则非常要害。在上述9种基因中,仅有FOXA1是此前现已发现的癌基因。该基因编码的蛋白质可以协助乳腺细胞呼应雌激素的信号进行成长,而该基因的骤变则会推进蛋白表达量的上调。实验成果也证明了这一定论。

研讨者们以为,受现在的研讨样本量约束,启动子骤变的挑选非常困难,成果也难以达到显著性区别。因而,后续的研讨中需求进一步添加样本量,以期取得更安稳的成果。


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(左丘瀚逸编辑《【→々帝都〆←】》2020年02月20日 09:35 )

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